干机的容量应该根据企业生产的规模或实验的需要来选择。冻干机一般分为三个系列：实验型系列、中试型及生产型系列，每一个系列中又有不同大小规模的型号。
实验室系列冻干机主要用于科研，其冻干量很小，冷凝器的结冰量每批小于10公斤，冻箱的板层面积小于0.5平方米，有些实验室型冻干机的冻干箱是钟罩型或多歧管型的。
中试型及小规模生产系列用于扩大试验及小生产之用。冷凝器的结冰量每批在10—40公斤之间，冻干箱的板层面积在0.5—2平方米之间。
生产型系列的冻干机用于工业大规模生产之用。冷凝器的结冰量每批在40—1600公斤之间，冻干箱的板层面积在3—80平方米之间。
用户应根据自己的生产量来决定需要选择哪种类型的冻干机，可以通过计算来确定某些数据。例如每批需冻干200公斤(升)液体量的产品，则首先应选用冷凝器结冰量不小于200公斤(升)的冻干机。然后计算出冻干箱板层的负荷面积，面积的计算与产品的装载方法有关。使用盘装法和瓶装法面积不一定相同。盘装法充分利用了板层的面积，而瓶装法由于瓶之间的间隙未充分利用，所需的板层面积较大。
